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(1)实验室检查：常规血、尿、粪便和生化检查。疑伤寒者作血培养及肥达试验。疑结核者作结核菌素试验。疑全身性疾病者作相应检查。
(2)内镜及影像学检查：除某些急性感染性肠炎如伤寒、痢疾、坏死性肠炎等之外，绝大多数下消化道出血的定位和病因需依靠内镜及影像学检查确诊。
结肠镜检查：是诊断大肠及回肠末段病变的首选检查方法。其优点是诊断敏感性高、可以‘发现活动性出血、结合活检病理检查可判断病变性质。检查时应当注意，如有可能，无论在何处发现病灶均应将镜端送至回肠末段，称为全结肠检查。
X线钡剂造影：X线钡剂灌肠多用于诊断大肠、回盲部及阑尾病变，一般主张进行双重气钡造影。优点是基层医院已普及，患者较易接受。缺点是对较平坦病变、广泛而较轻炎症性病变易漏诊，有时无法确定病变性质。因此对X线钡剂灌肠检查阴性的下消化道出血需进行结肠镜检查，已作结肠镜全结肠检查患者则不强调x线钡剂灌肠检查。
小肠X线钡剂造影是诊断小肠病变的重要方法。小肠X线钡剂造影检查敏感性低、漏诊率相当高。小肠气钡双重造影在一定程度上提高诊断正确率，但有一定难度，要求进行经口插管法小肠钡剂造影。
X线钡剂造影检查一般要求在大出血停止至少3天之后进行。
(3)放射性核素扫描或选择性腹部血管造影：必须在活动性出血时进行，适用于：内镜检查(特别是急诊内镜检查)及X线钡剂造影不能确定出血来源的不明原因出血;因为严重急性大量出血或其他原因不能进行内镜检查者。可根据情况选择放射性核素扫描或选择性血管造影检查，必要时亦可两种检查先后进行。
放射性核素扫描是静脉推注用99m锝标记的患者自体红细胞作腹部扫描，在出血速度>0.1ml/min时，标记红细胞在出血部位溢出形成浓染区，由此可判断出血部位，并且可监测出血达24小时。该检查创伤少，但存在假阳性和定位错误，可作为出血初步定位。本检查对Meckel憩室合并出血有重要诊断价值，约90%Meckel憩室合并出血者有异位胃黏膜存在，而异位胃黏膜对锝有浓集作用。对持续大出血患者宜及时作选择性腹腔动脉造影，在出血量>0.5ml/min时，可以发现造影剂在出血部位溢出，有比较准确的定位价值。对于某些血管病变如血管畸形和血管瘤、血管丰富的肿瘤还有定性价值。
(4)胶囊内镜或小肠镜检查：小肠镜可以直接观察各段小肠的出血病变。近年发明了胶囊内镜，患者在吞服胶囊内镜后，内镜在胃肠道拍摄的图像通过无线电发送至体外接收器进行图像分析，对小肠出血疾病诊断有价值，而且患者痛苦小。
(5)手术探查：各种检查不能明确出血灶，而持续大出血危及患者生命时，必须手术探查。有些微小病变特别是血管病变手术探查亦不易发现，此时可借助术中内镜检查帮助寻找出血灶。
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